Đầu tiên, một con tàu ngoài hành tinh kỳ lạ xuất hiện ở Tokyo, và sau đó một học sinh mới chuyển đến trường bí ẩn với một bộ đồng phục cổ điển. Tên của cậu là Muryou, và khi cậu ta đến, mọi thứ bắt đầu thay đổi.
sau khi Sau Gravion đã có thể sử dụng tuyệt chiêu của nó, là mối đe dọa Zeravire dường như có tạm thời dừng lại. Tuy nhiên khi nó tăng trở lại lên tất cả của một đột ngột, Gult Trái đất và con át chủ bài của mình, các siêu Robot Choujuushin Gravion, là cần thiết để bảo vệ thế giới này một lần nữa
Truyện kể về Ais trong hành trình tìm kiếm sức mạnh ở Dungeon cùng với các bạn của cô ấy. Sword princess Aiz Wallenstein. Today, once again, the strongest female swordsman heads to the giant labyrinth known as the "Dungeon" along with her allies.
Nhóm Takuya đanh trên chuyến hành trình của mình thì bị lạc đến Đảo Lang Thang. Khi Takuya, Tomoki, Junpei,, Bokomon và Neamon tỉnh lại thì gặp được Kotemon. Ngay lúc đó, các Digimon tộc thú được lãnh đạo bởi Hippogriffomon đến tấn công tộc người do Darrcmon lãnh đạo.
Satoru Mikami vốn đang có cuộc sống bình lặng thì bị một gã côn đồ đâm chết trên phố. Anh kết thúc cuộc đời ở tuổi 37. Bỗng nhiên khi lấy lại ý thức, anh không thể nghe, cũng không thể nhìn thấy gì. Anh phát hiện ra mình đã chuyển sinh thành một con Slime