Khi Kouichi (Tsuyoshi Kusanagi) lên 9 tuổi, bố Kouichi đã bị cáo buộc cho tội danh giết hại cả gia đình rồi tự sát. Nhưng thực tế là bố Kouichi và gia đình của anh đã bị sát hại và Kouichi đã chính mắt nhìn thấy hung thủ sát hại gia đình anh
Yamaguchi Kumiko (Nakama Yukie) là một giáo viên trẻ, bước vào nghề với đầy ước mơ và hoài bão và lý tưởng được cống hiến hết mình cho thế hệ tương lai. Vào làm việc tại trường Shirokin, không may cô được xếp chủ nhiệm lớp 3D, 1 lớp toàn học sinh cá biệt. Lúc mới đầu tất cả lớp 3D không 1 ai tin tưởng các giáo viên, nên họ tìm đủ mọi các khiến Kumiko phải từ bỏ vị trí chủ nhiệm, nhưng không hề lay chuyển được quyết tâm của Kumiko. Sawada Shin (Matsumoto Jun) là học sinh có ảnh hưởng lớn nhất
Sanada vốn là một gia tộc võ sĩ địa phương ở vùng Shinano (tỉnh Nagano ngày nay). Shinano là vùng đất nằm ngay trung tâm Nhật Bản, đất đai trù phú, rộng lớn, vẫn luôn là miếng mồi ngon cho nhiều lãnh chúa hùng mạnh láng giềng.
Một con quái vật tên Xibalba xuất hiện trong thành phố. Sau đó, một cậu bé tên là Frey xuất hiện và triệu hồi tim Roidmude. Ngày hôm sau, Takeru và Makoto xuất hiện đến hiện trường và gặp Frey và Tim Roidmude.Takeru và Makoto biến thành Ghost và Specter tương ứng và đưa về tim Roidmude.
Ultraman Zero: The Chronicle (ウルトラマンゼロ・ザ・クロニクル?) is a series that tells the story of Ultraman Zeros adventures. All episodes use footage from various Ultraman Zero films: Mega Monster Battle Ultra Galaxy Legends The Movie, Ultra Galaxy Legend Gaiden: Ultraman Zero vs. Darklops Zero