Ever since he was little, Takashi Natsume has been able to see what others could not, namely monstrous spirits known as Yokai. Natsumes late grandmother, Reiko, would challenge Yokai to contests and the ones that lost had to sign a contract with her, binding their names to her "Yujin-cho."
Sinh vật không xác định “Archon” đột nhiên xuất hiện và mang lại cho con người một cuộc khủng hoảng tuyệt chủng. Một quân đoàn đặc biệt “Goulart Knights” được thành lập để chống lại tấn công Archon. Các hiệp sĩ có sức mạnh siêu nhiên để tạo ra “Holy Grail” từ tinh thần và chiến đấu chống lại Archon của họ. Con chó như biến đổi thành một số điều điên rồ, và 2 con quái vật tiến tới có một số godzilla như cuộc chiến. Các “hiệp sĩ” sau đó quyết định để có một cuộc thi t-shirt ướt trong một thời
Những Giây Cuối Cùng Tới Thiên Đường: Haibara đã bị Tổ chức áo đen nghe lén những cuộc điện thoại và một trong những địa điểm mà Haibara sẽ có mặt là buổi khai trương được tổ chức tại tòa tháp đôi Tokyo. Tổ chức áo đen lên kế hoạch ám sát Haibara và những người có liên quan. Trong buổi khai trương, hàng loạt vụ giết người đã xảy ra, Conan nghi ngờ có sự xếp đặt của Tổ chức áo đen. Trong khi chưa tìm ra được manh mối thì tòa tháp đôi đã bị đánh bom . Hàng loạt vụ nổ xảy ra, tất cả chìm trong
Thế giới Số đã trở nên quá đông nên vị thần tối cao Yggdrasil quyết định thực hiện Project Ark với Chương Trình X diệt sạch Digimon. Chỉ những Digimon được mới được sống trong tân thế giới. Tuy nhiên có những Digimon mang trong người Kháng Thể X và sống đến tân thế giới. Nhưng Yggdrasil coi nhưng Digimon kháng thể X là kẻ ngoại đạo cần khai trừ. Giờ là lúc bắt đầu trận đánh sinh tử của Digimon với Yggdrasil.
Khi trò chơi điện tử trực tuyến nổi tiếng Yggdrasil bị đóng máy chủ, game thủ cô đơn Momonga quyết định ở lại và tiếp quản miền đất kỹ thuật số này.